Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms