Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNW1Q13573 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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