Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GCLMP48507 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GCLMP48507 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GCLMP48507 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms