Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUP10909 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUP10909 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLUP10909 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms