Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCATO75600 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCATO75600 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCATO75600 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms