Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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