Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms