Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELF4Q99607 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms