Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LINC01545Q5VT33 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms