Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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