Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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