Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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