Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORCP51449 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORCP51449 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms