Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TM4SF1P30408 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms