Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLRMTO00411 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLRMTO00411 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms