Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIMS3Q9UJD0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms