Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC148Q8NFR7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms