Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD1L3Q7Z443 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L3Q7Z443 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L3Q7Z443 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L3Q7Z443 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L3Q7Z443 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L3Q7Z443 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L3Q7Z443 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L3Q7Z443 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms