Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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