Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-215ENST00000510870 537 ntTSL 43.51□□□□□ -1.854e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 RBM22-208ENST00000522469 989 ntTSL 23.42□□□□□ -1.864e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PAK2-203ENST00000481344 371 ntTSL 23.42□□□□□ -1.864e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD4-211ENST00000498367 975 ntTSL 33.39□□□□□ -1.873e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.874e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.884e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GOLT1B-204ENST00000539663 876 ntTSL 33.31□□□□□ -1.884e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SEC63-208ENST00000473746 709 ntTSL 23.28□□□□□ -1.884e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ERN1-202ENST00000577567 398 ntTSL 53.19□□□□□ -1.94e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 IFT52-205ENST00000467024 515 ntTSL 23.07□□□□□ -1.924e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PPP2CB-209ENST00000523023 448 ntTSL 33.05□□□□□ -1.924e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB8OS-203ENST00000373506 766 ntTSL 33.03□□□□□ -1.925e-11■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LCOR-208ENST00000493486 245 ntTSL 33.01□□□□□ -1.934e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.934e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DAD1-202ENST00000489532 339 ntTSL 32.99□□□□□ -1.934e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NUP54-210ENST00000510884 441 ntTSL 32.9□□□□□ -1.954e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SNW1-202ENST00000553565 564 ntTSL 22.8□□□□□ -1.964e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HEXB-203ENST00000504459 899 ntTSL 32.75□□□□□ -1.974e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLIRP-202ENST00000553981 285 ntTSL 32.73□□□□□ -1.974e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DOCK4-209ENST00000464338 459 ntTSL 42.69□□□□□ -1.984e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FNBP4-205ENST00000526109 673 ntTSL 32.67□□□□□ -1.984e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.982e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MTMR12-206ENST00000510216 444 ntTSL 22.64□□□□□ -1.994e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBED5-203ENST00000525350 3677 ntTSL 22.59□□□□□ -1.994e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -22e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB8OS-209ENST00000473294 620 ntTSL 52.54□□□□□ -25e-11■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 RPL7-206ENST00000435330 445 ntTSL 32.52□□□□□ -2.011e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 KLHL23-204ENST00000448589 594 ntTSL 22.5□□□□□ -2.014e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.042e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBR1-211ENST00000569971 721 ntTSL 42.28□□□□□ -2.044e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-208ENST00000503745 433 ntTSL 32.22□□□□□ -2.054e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 NUP54-209ENST00000510569 494 ntTSL 51.87□□□□□ -2.114e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLIRP-208ENST00000556956 450 ntTSL 21.84□□□□□ -2.124e-15■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-201ENST00000339754 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-202ENST00000450991 2446 ntTSL 1 (best)6.58□□□□□ -1.369e-7■■■■■ 30.3
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PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-214ENST00000639038 2423 ntTSL 56.3□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 30.3
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PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-203ENST00000537796 3418 ntTSL 55.97□□□□□ -1.459e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-204ENST00000540083 863 ntTSL 55.94□□□□□ -1.469e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-213ENST00000638883 3940 ntTSL 55.65□□□□□ -1.59e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-220ENST00000639841 1982 ntTSL 55.36□□□□□ -1.559e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-208ENST00000545807 3113 ntTSL 55.36□□□□□ -1.559e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-226ENST00000640481 3216 ntTSL 55.34□□□□□ -1.569e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NECAP1-222ENST00000640072 3456 ntTSL 54.23□□□□□ -1.739e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 WDR62-202ENST00000378860 1980 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 WDR62-204ENST00000427823 955 ntTSL 514.44□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 WRAP73-210ENST00000497940 1101 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 WRAP73-207ENST00000471223 6089 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.61e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 ATG13-210ENST00000528145 579 ntTSL 311.23□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt10.22□□□□□ -0.771e-13■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 57.58□□□□□ -1.21e-13■■■■■ 30.3
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