RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528145.5

ATG13-210, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-210ENST00000528145 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.23■■■□□ 2.75
ATG13-210ENST00000528145 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.6■■■□□ 2.17
ATG13-210ENST00000528145 ABCC9O60706 1549 aa27.72■■■□□ 2.03
ATG13-210ENST00000528145 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ATG13-210ENST00000528145 NACADO15069 1562 aa26.79■■□□□ 1.88
ATG13-210ENST00000528145 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.76■■□□□ 1.87
ATG13-210ENST00000528145 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.71■■□□□ 1.87
ATG13-210ENST00000528145 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.7■■□□□ 1.87
ATG13-210ENST00000528145 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.68■■□□□ 1.86
ATG13-210ENST00000528145 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.24■■□□□ 1.79
ATG13-210ENST00000528145 SCRIBQ14160 1630 aa26.12■■□□□ 1.77
ATG13-210ENST00000528145 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.99■■□□□ 1.75
ATG13-210ENST00000528145 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
ATG13-210ENST00000528145 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.71■■□□□ 1.71
ATG13-210ENST00000528145 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ATG13-210ENST00000528145 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG13-210ENST00000528145 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG13-210ENST00000528145 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG13-210ENST00000528145 SMARCA4P51532 1647 aa25■■□□□ 1.59
ATG13-210ENST00000528145 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ATG13-210ENST00000528145 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG13-210ENST00000528145 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG13-210ENST00000528145 SMARCA2P51531 1590 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG13-210ENST00000528145 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.74■■□□□ 1.55
ATG13-210ENST00000528145 NCAPD3P42695 1498 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG13-210ENST00000528145 HMGXB3Q12766 1538 aa24.65■■□□□ 1.54
ATG13-210ENST00000528145 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
ATG13-210ENST00000528145 WIZO95785 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
ATG13-210ENST00000528145 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
ATG13-210ENST00000528145 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ATG13-210ENST00000528145 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ATG13-210ENST00000528145 NESP48681 1621 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG13-210ENST00000528145 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG13-210ENST00000528145 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG13-210ENST00000528145 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.97■■□□□ 1.43
ATG13-210ENST00000528145 CFTRP13569 1480 aa23.91■■□□□ 1.42
ATG13-210ENST00000528145 ERCC6Q03468 1493 aa23.86■■□□□ 1.41
ATG13-210ENST00000528145 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.83■■□□□ 1.41
ATG13-210ENST00000528145 PRDM2Q13029 1718 aa23.83■■□□□ 1.41
ATG13-210ENST00000528145 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.82■■□□□ 1.4
ATG13-210ENST00000528145 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.73■■□□□ 1.39
ATG13-210ENST00000528145 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
ATG13-210ENST00000528145 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.68■■□□□ 1.38
ATG13-210ENST00000528145 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.61■■□□□ 1.37
ATG13-210ENST00000528145 WDR62O43379 1518 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG13-210ENST00000528145 CUX2O14529 1486 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG13-210ENST00000528145 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ATG13-210ENST00000528145 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG13-210ENST00000528145 TOPBP1Q92547 1522 aa23.39■■□□□ 1.34
ATG13-210ENST00000528145 ABCC8Q09428 1581 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG13-210ENST00000528145 CUX1P39880 1505 aa23.32■■□□□ 1.32
ATG13-210ENST00000528145 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
ATG13-210ENST00000528145 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ATG13-210ENST00000528145 SYNJ1O43426 1573 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG13-210ENST00000528145 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG13-210ENST00000528145 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG13-210ENST00000528145 TOP2BQ02880 1626 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG13-210ENST00000528145 IFT140Q96RY7 1462 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG13-210ENST00000528145 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ATG13-210ENST00000528145 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG13-210ENST00000528145 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ATG13-210ENST00000528145 SOGA1O94964 1423 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG13-210ENST00000528145 WDR97A6NE52 1622 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG13-210ENST00000528145 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ATG13-210ENST00000528145 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG13-210ENST00000528145 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.267e-6■□□□□ 9.9
ATG13-210ENST00000528145 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ATG13-210ENST00000528145 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG13-210ENST00000528145 PBRM1Q86U86 1689 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG13-210ENST00000528145 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG13-210ENST00000528145 GRIN2BQ13224 1484 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG13-210ENST00000528145 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.77■■□□□ 1.24
ATG13-210ENST00000528145 TRIM41Q8WV44 630 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG13-210ENST00000528145 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ATG13-210ENST00000528145 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG13-210ENST00000528145 CHD1O14646 1710 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG13-210ENST00000528145 KIF27Q86VH2 1401 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG13-210ENST00000528145 ADAMTS12P58397 1594 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG13-210ENST00000528145 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG13-210ENST00000528145 SYNJ2O15056 1496 aa22.63■■□□□ 1.21
ATG13-210ENST00000528145 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.59■■□□□ 1.21
ATG13-210ENST00000528145 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG13-210ENST00000528145 CUL7Q14999 1698 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG13-210ENST00000528145 IGF1RP08069 1367 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG13-210ENST00000528145 FBLN2P98095 1184 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG13-210ENST00000528145 GRIN2AQ12879 1464 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG13-210ENST00000528145 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG13-210ENST00000528145 OSCARQ8IYS5 282 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG13-210ENST00000528145 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG13-210ENST00000528145 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.44■■□□□ 1.18
ATG13-210ENST00000528145 CEP170Q5SW79 1584 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG13-210ENST00000528145 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.43■■□□□ 1.18
ATG13-210ENST00000528145 NUP160Q12769 1436 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG13-210ENST00000528145 EEA1Q15075 1411 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG13-210ENST00000528145 PRXQ9BXM0 1461 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG13-210ENST00000528145 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG13-210ENST00000528145 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ATG13-210ENST00000528145 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG13-210ENST00000528145 ARHGEF11O15085 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG13-210ENST00000528145 SHROOM2Q13796 1616 aa22.25■■□□□ 1.15
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