Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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GBX1Q14549 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBX1Q14549 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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