Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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