Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VBP1P61758 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VBP1P61758 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms