Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms