Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP3-1Q9BYR8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms