Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRTAP3-1Q9BYR8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRTAP3-1Q9BYR8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KRTAP3-1Q9BYR8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP3-1Q9BYR8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP3-1Q9BYR8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP3-1Q9BYR8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP3-1Q9BYR8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP3-1Q9BYR8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP3-1Q9BYR8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP3-1Q9BYR8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP3-1Q9BYR8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP3-1Q9BYR8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP3-1Q9BYR8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP3-1Q9BYR8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP3-1Q9BYR8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP3-1Q9BYR8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP3-1Q9BYR8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP3-1Q9BYR8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP3-1Q9BYR8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP3-1Q9BYR8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP3-1Q9BYR8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP3-1Q9BYR8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP3-1Q9BYR8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP3-1Q9BYR8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP3-1Q9BYR8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP3-1Q9BYR8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP3-1Q9BYR8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP3-1Q9BYR8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP3-1Q9BYR8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP3-1Q9BYR8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP3-1Q9BYR8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP3-1Q9BYR8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP3-1Q9BYR8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP3-1Q9BYR8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KRTAP3-1Q9BYR8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KRTAP3-1Q9BYR8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms