Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTKNQ9BST9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTKNQ9BST9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms