Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.329e-7■■■■□ 23.9
PCBP2Q15366 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 23.9
PCBP2Q15366 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■□ 23.9
PCBP2Q15366 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.355e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.625e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.725e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 CHN2-203ENST00000409350 539 ntTSL 413.37□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 CHN2-213ENST00000439384 578 ntTSL 512.31□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 CHN2-205ENST00000409964 547 ntTSL 49.97□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 CHN2-220ENST00000474070 754 ntTSL 58.84□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 516.57■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 BAX-208ENST00000503726 488 ntTSL 214.91□□□□□ -0.027e-11■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 BAX-212ENST00000515540 300 ntTSL 314.67□□□□□ -0.067e-11■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.598e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.68e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.678e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.688e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.758e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 SNTB1-205ENST00000520717 559 ntTSL 227.26■■□□□ 1.954e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.749e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.249e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.415e-8■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 ATXN10-204ENST00000435026 653 ntTSL 39.84□□□□□ -0.833e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 TXNDC12-202ENST00000469458 446 ntTSL 39.1□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.793e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 SYN3-207ENST00000462268 488 ntTSL 38.26□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 TIAL1-210ENST00000479729 485 ntTSL 316.77■□□□□ 0.288e-11■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 COL9A3-207ENST00000467819 993 ntTSL 1 (best)19.36■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 COL9A3-205ENST00000466192 2194 ntTSL 217.95■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 COL9A3-203ENST00000462700 1237 ntTSL 317.79■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 COL9A3-206ENST00000466532 539 ntTSL 217.66■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.184e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MDK-209ENST00000489525 1339 ntTSL 523.55■■□□□ 1.365e-14■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.195e-14■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.075e-14■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.055e-14■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.715e-14■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-14■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.525e-14■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.495e-14■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 ZDHHC14-207ENST00000518214 861 ntTSL 310.29□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-210ENST00000453112 552 ntTSL 419.83■□□□□ 0.773e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-209ENST00000452832 485 ntTSL 218.71■□□□□ 0.593e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-214ENST00000462326 536 ntTSL 416.82■□□□□ 0.283e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-215ENST00000471168 582 ntTSL 414.24□□□□□ -0.133e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-202ENST00000414113 539 ntTSL 414.2□□□□□ -0.143e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-213ENST00000455023 574 ntTSL 414.15□□□□□ -0.143e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.333e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.363e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-212ENST00000454227 610 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.563e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-208ENST00000433959 2900 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.783e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-211ENST00000453256 649 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.813e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-203ENST00000417399 591 ntTSL 49.4□□□□□ -0.93e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-216ENST00000481197 583 ntTSL 29.31□□□□□ -0.923e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.13e-9■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 S100A16-205ENST00000474991 640 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-18■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.684e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.14e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.251e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.171e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 TNXB-202ENST00000442721 372 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 RTKN-209ENST00000484453 820 ntTSL 1 (best)21.03■□□□□ 0.966e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 RTKN-205ENST00000464094 1266 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.926e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 RTKN-208ENST00000479256 564 ntTSL 515□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 RTKN-204ENST00000460968 842 ntTSL 213.45□□□□□ -0.266e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 RTKN-207ENST00000472518 1105 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 DGAT1-204ENST00000525371 840 ntTSL 519.08■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 HNRNPA1-205ENST00000547566 1234 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.044e-18■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.754e-18■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 HNRNPA1-211ENST00000551665 925 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-18■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.434e-18■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.532e-7■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 POGZ-212ENST00000485040 2741 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 23.8
PCBP2Q15366 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.764e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.17e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.247e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.37e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.597e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.97e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 SLC16A3-210ENST00000580189 872 ntTSL 518.6■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.534e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.714e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 NGDN-211ENST00000556699 725 ntTSL 27.32□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.341e-9■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.11e-9■■■■□ 23.7
PCBP2Q15366 SLC12A7-203ENST00000510943 421 ntTSL 311.13□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 23.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 205.8 ms