RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484453.1

RTKN-209, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RTKN, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-209ENST00000484453 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54■■■■■ 6.24
RTKN-209ENST00000484453 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.18■■■■■ 5.3
RTKN-209ENST00000484453 ABCC9O60706 1549 aa47.3■■■■■ 5.16
RTKN-209ENST00000484453 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.27■■■■■ 4.84
RTKN-209ENST00000484453 NACADO15069 1562 aa45.17■■■■■ 4.82
RTKN-209ENST00000484453 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.1■■■■■ 4.81
RTKN-209ENST00000484453 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
RTKN-209ENST00000484453 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.81■■■■■ 4.76
RTKN-209ENST00000484453 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.65■■■■■ 4.74
RTKN-209ENST00000484453 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.5■■■■■ 4.71
RTKN-209ENST00000484453 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.18■■■■■ 4.66
RTKN-209ENST00000484453 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.15■■■■■ 4.66
RTKN-209ENST00000484453 SCRIBQ14160 1630 aa43.95■■■■■ 4.63
RTKN-209ENST00000484453 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.88■■■■■ 4.62
RTKN-209ENST00000484453 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.33■■■■■ 4.53
RTKN-209ENST00000484453 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
RTKN-209ENST00000484453 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.67■■■■■ 4.42
RTKN-209ENST00000484453 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.5■■■■■ 4.39
RTKN-209ENST00000484453 SMARCA4P51532 1647 aa42.01■■■■■ 4.32
RTKN-209ENST00000484453 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
RTKN-209ENST00000484453 SMARCA2P51531 1590 aa41.67■■■■■ 4.26
RTKN-209ENST00000484453 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.64■■■■■ 4.26
RTKN-209ENST00000484453 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.64■■■■■ 4.26
RTKN-209ENST00000484453 NCAPD3P42695 1498 aa41.58■■■■■ 4.25
RTKN-209ENST00000484453 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.51■■■■■ 4.24
RTKN-209ENST00000484453 HMGXB3Q12766 1538 aa41.49■■■■■ 4.23
RTKN-209ENST00000484453 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
RTKN-209ENST00000484453 WIZO95785 1651 aa41.33■■■■■ 4.21
RTKN-209ENST00000484453 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
RTKN-209ENST00000484453 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
RTKN-209ENST00000484453 NESP48681 1621 aa40.78■■■■■ 4.12
RTKN-209ENST00000484453 ERCC6Q03468 1493 aa40.71■■■■■ 4.11
RTKN-209ENST00000484453 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.62■■■■■ 4.09
RTKN-209ENST00000484453 CUX2O14529 1486 aa40.44■■■■■ 4.06
RTKN-209ENST00000484453 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.4■■■■■ 4.06
RTKN-209ENST00000484453 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.36■■■■■ 4.05
RTKN-209ENST00000484453 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.25■■■■■ 4.03
RTKN-209ENST00000484453 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.25■■■■■ 4.03
RTKN-209ENST00000484453 PRDM2Q13029 1718 aa40.23■■■■■ 4.03
RTKN-209ENST00000484453 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
RTKN-209ENST00000484453 CFTRP13569 1480 aa40.15■■■■■ 4.02
RTKN-209ENST00000484453 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.1■■■■■ 4.01
RTKN-209ENST00000484453 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
RTKN-209ENST00000484453 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.98■■■■□ 3.99
RTKN-209ENST00000484453 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.96■■■■□ 3.99
RTKN-209ENST00000484453 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.88■■■■□ 3.98
RTKN-209ENST00000484453 WDR62O43379 1518 aa39.78■■■■□ 3.96
RTKN-209ENST00000484453 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
RTKN-209ENST00000484453 TOPBP1Q92547 1522 aa39.36■■■■□ 3.89
RTKN-209ENST00000484453 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.36■■■■□ 3.89
RTKN-209ENST00000484453 ABCC8Q09428 1581 aa39.33■■■■□ 3.89
RTKN-209ENST00000484453 CUX1P39880 1505 aa39.09■■■■□ 3.85
RTKN-209ENST00000484453 IFT140Q96RY7 1462 aa39.07■■■■□ 3.85
RTKN-209ENST00000484453 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
RTKN-209ENST00000484453 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
RTKN-209ENST00000484453 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.95■■■■□ 3.83
RTKN-209ENST00000484453 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
RTKN-209ENST00000484453 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
RTKN-209ENST00000484453 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.85■■■■□ 3.81
RTKN-209ENST00000484453 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.85■■■■□ 3.81
RTKN-209ENST00000484453 SOGA1O94964 1423 aa38.81■■■■□ 3.8
RTKN-209ENST00000484453 SYNJ1O43426 1573 aa38.79■■■■□ 3.8
RTKN-209ENST00000484453 WDR97A6NE52 1622 aa38.78■■■■□ 3.8
RTKN-209ENST00000484453 TOP2BQ02880 1626 aa38.78■■■■□ 3.8
RTKN-209ENST00000484453 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.78■■■■□ 3.8
RTKN-209ENST00000484453 OSCARQ8IYS5 282 aa38.75■■■■□ 3.79
RTKN-209ENST00000484453 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.68■■■■□ 3.781e-7■□□□□ 9
RTKN-209ENST00000484453 TRIM41Q8WV44 630 aa38.6■■■■□ 3.77
RTKN-209ENST00000484453 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
RTKN-209ENST00000484453 PBRM1Q86U86 1689 aa38.57■■■■□ 3.76
RTKN-209ENST00000484453 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.53■■■■□ 3.76
RTKN-209ENST00000484453 CHD1O14646 1710 aa38.52■■■■□ 3.76
RTKN-209ENST00000484453 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.49■■■■□ 3.75
RTKN-209ENST00000484453 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.41■■■■□ 3.74
RTKN-209ENST00000484453 GRIN2BQ13224 1484 aa38.38■■■■□ 3.73
RTKN-209ENST00000484453 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.37■■■■□ 3.73
RTKN-209ENST00000484453 FBLN2P98095 1184 aa38.3■■■■□ 3.72
RTKN-209ENST00000484453 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
RTKN-209ENST00000484453 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.2■■■■□ 3.7
RTKN-209ENST00000484453 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.2■■■■□ 3.7
RTKN-209ENST00000484453 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.2■■■■□ 3.7
RTKN-209ENST00000484453 SYNJ2O15056 1496 aa38.14■■■■□ 3.7
RTKN-209ENST00000484453 ADAMTS12P58397 1594 aa38.12■■■■□ 3.69
RTKN-209ENST00000484453 ARHGEF11O15085 1522 aa38.12■■■■□ 3.69
RTKN-209ENST00000484453 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.1■■■■□ 3.69
RTKN-209ENST00000484453 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
RTKN-209ENST00000484453 KIF27Q86VH2 1401 aa37.96■■■■□ 3.67
RTKN-209ENST00000484453 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.92■■■■□ 3.66
RTKN-209ENST00000484453 GRIN2AQ12879 1464 aa37.91■■■■□ 3.66
RTKN-209ENST00000484453 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.91■■■■□ 3.66
RTKN-209ENST00000484453 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.9■■■■□ 3.66
RTKN-209ENST00000484453 CUL7Q14999 1698 aa37.87■■■■□ 3.65
RTKN-209ENST00000484453 ARAP1Q96P48 1450 aa37.81■■■■□ 3.64
RTKN-209ENST00000484453 CEP170Q5SW79 1584 aa37.79■■■■□ 3.64
RTKN-209ENST00000484453 IGF1RP08069 1367 aa37.73■■■■□ 3.63
RTKN-209ENST00000484453 NUP160Q12769 1436 aa37.7■■■■□ 3.62
RTKN-209ENST00000484453 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.66■■■■□ 3.62
RTKN-209ENST00000484453 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.55■■■■□ 3.6
RTKN-209ENST00000484453 SHROOM2Q13796 1616 aa37.54■■■■□ 3.6
RTKN-209ENST00000484453 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.42■■■■□ 3.58
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