Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL9P32969 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL9P32969 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL9P32969 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL9P32969 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms