Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNKO75909 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNKO75909 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms