Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDE6DO43924 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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