Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNMO15061 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNMO15061 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNMO15061 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNMO15061 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNMO15061 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNMO15061 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNMO15061 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNMO15061 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms