Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF215Q9Y6U7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF215Q9Y6U7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF215Q9Y6U7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF215Q9Y6U7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms