Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F9

WNT6, Protein Wnt-6, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT6Q9Y6F9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
WNT6Q9Y6F9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT6Q9Y6F9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT6Q9Y6F9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT6Q9Y6F9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT6Q9Y6F9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT6Q9Y6F9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT6Q9Y6F9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT6Q9Y6F9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT6Q9Y6F9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT6Q9Y6F9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT6Q9Y6F9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms