Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPO11Q9Y5K1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPO11Q9Y5K1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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