Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB9Q9Y5E1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB9Q9Y5E1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB9Q9Y5E1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms