Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED7Q9Y3B3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED7Q9Y3B3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms