Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
THRAP3Q9Y2W1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
THRAP3Q9Y2W1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
THRAP3Q9Y2W1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
THRAP3Q9Y2W1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms