Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH1Q9Y2L9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRCH1Q9Y2L9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRCH1Q9Y2L9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms