Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN8AQ9UQD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN8AQ9UQD0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN8AQ9UQD0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms