Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGTPBP1Q9UPW5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms