Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM35Q9UPQ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TRIM35Q9UPQ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM35Q9UPQ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
TRIM35Q9UPQ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRIM35Q9UPQ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRIM35Q9UPQ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRIM35Q9UPQ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM35Q9UPQ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM35Q9UPQ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms