Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4E1Q9UPM8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4E1Q9UPM8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP4E1Q9UPM8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4E1Q9UPM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms