Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPK3Q9UPE1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPK3Q9UPE1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms