Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A4Q9UP95 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC12A4Q9UP95 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.6 ms