Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FZD1Q9UP38 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FZD1Q9UP38 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FZD1Q9UP38 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FZD1Q9UP38 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms