Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ALKQ9UM73 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ALKQ9UM73 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ALKQ9UM73 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ALKQ9UM73 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms