Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD4Q9ULV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD4Q9ULV1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD4Q9ULV1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms